牧羊犬咬人后，伤口是否会有毒取决于狗是否携带病毒。因为只有携带病毒的狗咬人，伤口才可能感染病毒，如狂犬病病毒。大多数狗虽然携带病毒，但不会发病，所以被咬后不一定会得狂犬病。

如果狗没有携带病毒，即使伤口较深，也不会出现中毒症状。但如果狗携带病毒并且伤口较深，那么伤口处会中毒，引起头晕、恶心、肌肉痉挛等症状。

因此，当被牧羊犬咬伤后，需要立即使用肥皂水清洗伤口，并前往医院就诊，由医生评估伤情并注射狂犬疫苗，以预防狂犬病的发生。

以上信息仅供参考，如有需要，建议咨询专业医生。